生物信息学常用的软件有哪些？

生物信息学常用的软件有哪些？

NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)-GenBank数据库数据库相似性搜索——核酸序列与核酸数据库比较（BLASTN） 蛋白质序列与数据库中蛋白质序列比较（BLASTP） 两序列比对（Align two sequences）DNA序列分析——ORF Finder(www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)分析实验序列外显子部分——GENSCAN（http://genes.mit.edu/GENSCAN.html）分析实验序列的可能酶切位点——NEBcutter2.0 (http://tools.neb.com/NEBcutter2/index.php) 注： Custom digest -- view gel限制性内切酶数据库——REBASE(http://rebase.neb.com/rebase/rebase.html)设计引物扩增实验序列——Genefisher Primer 3蛋白质序列分析及结构预测： 1.预测蛋白质的分子量及等电点:ExPASy（Compute pI/Mw） 2.分析蛋白质的基本物理化学性质：ExPASy（ProtParam） 3.分析蛋白质的亲水性和疏水性：ExPASy（ProtScale） 4.分析蛋白质在各种蛋白酶和各种化学试剂处理后的内切产物：ExPASy（PeptideMass） [* ：kinase K] 5.分析蛋白质的信号肽：ExPASy（SignalP） 6.预测蛋白质的二级结构：ExPASy（Jpred 3）多物种分子系统发育分析：EMBL（www.ebi.ac.uk/embl/)--Toolbox--Clustal2W人脂联素蛋白质序列：NP_004788人类胰岛素生长因子IB前体：P05019